Не пробовали воспользоваться функцией Request total from seller в разделе выигранных лотов (Won), или Need to pay?
Справа от названий требующих оплаты пунктов есть кнопочка Pay now, под ней - More actions. Первый пункт More actions - как раз Request total from seller если несколько покупок у одного прода. Если она поддерживается, там есть раскрывающееся окошко для вашего коммента проду (ну, типа, было бы хорошо получить от вас дискаунт за комплексную покупку и комбинированную отправку). Даже если прод не комбайнит, по крайней мере, платежи сложатся в один и в банковской выписке будет 1 транзакция.
Или прямым сообщением проду через описание одного из пунктов (Contact seller), например: "пришлите, пожалуйста, один инвойс для следующих пунктов" и перечисляете ID ваших покупок у него.
Скидка обычно делается после покупки, но до оплаты. Меня некоторые проды "узнают" и делают скидку не только на комбинированную отправку, но и на суммированную цену или даже при первой комплексной покупке могут скинуть и с цены и с доставки. Хотя, такое радушие, конечно, большая редкость.